• Prøver og svar
  •  : DNA-analyser
  •  : Apolipoprotein E genotype
   Udskriv

Kommentar til artiklen

Kontakt redaktionen

Apolipoprotein E genotype

Lægehåndbogen - http://www.laegehaandbogen.dk

Apolipoprotein E genotype

Definition

  • Genotypen svarende til en hyppig polymorfi i det gen (APOE) der koder for apolipoprotein E (apoE)

Apolipoprotein E (apoE)

  • ApoE er et lille glykoprotein som findes i flere lipoproteiner i blodet, især VLDL og HDL, og som spiller en rolle i deres omsætning, samt i udvekslingen af lipider mellem forskellige væv og lipoproteinerne
  • Proteinet fungerer også som lokal lipidtransportør i vævene og har en fremtrædende rolle som lipidtransportør i cerebrospinalvæsken
  • Derudover har proteinet en række andre funktioner, herunder en evne til at stimulere og hæmme forskellige celletyper

De almindelige genotyper

  • APOE sidder på kromosom 19. Der er beskrevet mange polymorfier i genet, men de fleste er sjældne eller lokaliseret i ikke-kodende regioner
  • Der findes imidlertid to enkelt-base polymorfier, som resulterer i 3 almindeligt forekommende alleler: APOE*2, APOE*3 og APOE*4
    • De 3 alleler giver 6 forskellige genotyper: APOE 2-2, APOE 2-3, APOE 3-3, APOE 2-4, APOE 3-4 og APOE 4-4
    • Allelerne koder for apoE isoformer, hvis aminosyresekvenser kun er forskellige i position 112 og 158 — apoE2 har cystein i begge positioner, mens apoE3 har henholdsvis cystein og arginin, og apoE4 har arginin i begge positioner
    • Trods disse beskedne forskelle i primærstrukturen, er der tydelige forskelle i isoformernes sekundær- og tertiærstruktur, og markante forskelle i deres funktionelle egenskaber
  • Der er betydelige forskelle i hyppigheden (frekvensen) af de tre alleler i forskellige populationer
  • Allelfrekvenserne i den danske befolkning (for personer af nordeuropæisk oprindelse) er:
Allel Frekvens
APOE*2 8,2%
APOE*3 74,8%
APOE*4 17,0%
  • Og de tilsvarende procentdele (afrundede) med de 6 forskellige genotyper er:
Genotype Frekvens
APOE 2-2 1%
APOE 2-3 12%
APOE 3-3 56%
APOE 2-4 3%
APOE 3-4 25%
APOE 4-4 3%

Association til sygdom

  • Genotypen APOE 2-2 medfører øget risiko for udvikling af familiær dysbetalipoproteinæmi (restpartikelhyperlipidæmi, type III hyperlipidæmi)
  • Genotypen APOE 4-4 medfører øget risiko for udvikling af Alzheimers sygdom
  • Genotyperne APOE 3-4 og 4-4 medfører øget risiko for udvikling af (især) aterosklerotisk betinget kardiovaskulær sygdom og er forbundet med øget dødelighed af disse sygdomme

Indikationer

  • Der er ingen indikationer for at anvende undersøgelsen i almen praksis
  • Specialister kan eventuelt anvende undersøgelsen som supplement til andre undersøgelser i udredningen af patienter (og deres familier) med:
    • Familiær dysbetalipoproteinæmi
    • Alzheimers sygdom

Prøvetagning

Fortolkning

  • Det er en specialistopgave

Kilder

Referencer

  • Gerdes LU. Some epidemiological aspects of the common apolipoprotein E polymorphism. Aarhus Universitet, 2002 (doktordisputats) [link til dokumentet].
  • Frikke-Schmidt R, Tybjaerg-Hansen A, Steffensen R, Jensen G, Nordestgaard BG: Apolipoprotein E genotype: epsilon32 women are protected while epsilon43 and epsilon44 men are susceptible to ischemic heart disease: the Copenhagen City Heart Study. J Am Coll Cardiol 2000; 35:1192-1199.
  • Gerdes LU. The common polymorphism of apolipoprotein E: Geographical aspects and new pathophysiological relations. Clin Chem Lab Med 2003; 41: 628-631.
  • Huang Y. Mechanisms linking apolipoprotein E isoforms with cardiovascular and neurological diseases. Curr Opin Lipidol. 2010 Aug;21(4):337-345.

Fagmedarbejdere

  • Ulrik Gerdes, overlæge, dr. med., Klinisk Biokemisk Laboratorium, Århus Universitetshospital, Risskov
  • Hans Christian Kjeldsen, læge, ph.d., Aarhus Universitet, afd. for almen medicin, Institut for Folkesundhed

Datoer

  • Publiceret: 01.03.2011
  • Seneste redaktionelle revidering: 01.03.2011